Peptide YY có liên quan đến họ peptide của tuyến tụy do chúng có 18 trên tổng số 36 axit amin nằm ở cùng vị trí với peptide tuyến tụy.[5] Hai dạng chính của peptide YY là PYY1-36 và PYY3-36, có các motif cấu trúc gấp PP. Tuy nhiên, dạng phổ biến nhất của PYY tuần hoàn với khả năng miễn dịch là PYY3-36, liên kết với thụ thể Y2 (Y2R) của họ thụ thể Y.[6] Peptide PYY3-36 (PYY) là một polypeptide dạng thẳng gồm 34 axit amin và là đồng đẳng với NPY và polypeptide tuyến tụy.